<br><p>conda是生物信息分析必备的环境,集成了很多优秀的软件,关键是解决了依赖包的问题,很好用。记录一下我安装conda的心得。</p><p>conda有miniconda和anaconda,我推荐还是使用miniconda吧,自己去安装一些东西,可能好使用一些。</p><p>conda的下载</p><p>下载对应版本即可,我下载的是linux的64位版本。</p><p>进入/root目录</p><p>cd /root</p><p>下载conda:</p><p>wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh</p><p>conda的安装</p><p>安装命令:</p><p>bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh</p><p>一路安装下来,最后一步,一般选择no,不把conda加入环境,避免启动系统的时候就加载conda,后面我们想办法,让他在需要的时候再启动。</p><p>如果没有选择no取消自动启动,那么登录shell的时候自动进去base环境,我们可以运行命令conda config --set auto_acti【【微信】】来取消,如果反悔了,可以使用命令conda config --set auto_acti【【微信】】来重新自动进入base环境。</p><p>个人习惯,我喜欢把我的东西放到一个比较大的挂载分区,一般不和系统放在一起。</p><p>我把conda安装到/www/soft/miniconda3。</p><p>安装完成之后,输入命令:cd? /www/soft/miniconda3/bin</p><p>chmod 777 activate</p><p>然后把conda启动:</p><p>. http://www.taodudu.cc/news/activate</p><p>然后建立单独的自用环境</p><p>conda create -n pepper python=2</p><p>聪明人一眼就可以看出来,建立环境的作用就是可以区分python,分别建立python2和python3的环境,那么在不同的环境就可以使用不同版本python的软件。</p><p>然后把这个环境的启动加入bashrc。</p><p>输入命令:</p><p>vim ~/.bashrc</p><p>insert以下命令:</p><p>alias condapepper='. /www/soft/miniconda3/bin/acti【【微信】】'</p><p>也可以把这条命令单独放一行,重新加载一次系统配置使得alias命令生效,并且自动进去pepper环境</p><p>source ~/.bashrc</p><p>重启一样的效果。</p><p>然后输入命令</p><p>condapepper</p><p>成功启动conda的pepper环境。</p><p>加入频道conda config --add channels bioconda</p><p>conda config --add channels conda-forge</p><p>conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/</p><p>conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/</p><p>conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/</p><p>conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/</p><p>conda的卸载</p><p>如果你是想卸载conda然后重装,那么最好先关闭相关目录进程</p><p>运行命令</p><p>fuser -km /www/soft/miniconda3/</p><p>然后</p><p>rm -rf? /www/soft/miniconda3/</p><p>conda的环境的退出</p><p>conda deactivate</p><p>特别提示:</p><p>如果在.bashrc文件中设置了登陆系统时自动进入canda的自定义环境,那么在本地登录系统想使用桌面的时候,一定要先退出环境,不然运行“startx”将出现错误,无法登录。</p><p>常用命令</p><p>查看condaconda info</p><p>查看包conda list</p><p>查看环境清单conda env list</p><p>安装包,比如snpeff【【微信】】</p><p>安装指定版本包,比如snpeff v4.3【【微信】】=4.3</p><p>删除包【【微信】】</p><p>从当前环境中移除包conda remo【【微信】】</p><p>更新某个包,比如snpeffconda update snpeff</p><p>更新所有包conda update --all</p><p>更新condaconda update conda</p><p>出了各种各样不知名的错误之后可以尝试这个命令</p><p>取消自动base环境命令conda config --set auto_acti【【微信】】</p><p>使用自动base环境命令就是设置为true了</p><p>取消SSL命令conda config --set ssl_【【微信】】</p><p>删除虚拟环境conda remove -n pepper --all</p><p>pepper为虚拟环境名称</p><p>删除虚拟环境中的某个包conda remo【【微信】】</p><p>pepper为虚拟环境名称,snpeff为包名</p><p>喜欢 (5)or分享 (0)</p> <hr><h1 style="font-size: 38px;color: #4d4f53;">lenovo打印机驱动卸载 lenovomodern怎么卸载</h1><br> <div> <div> 展开全部 </div> </div> <div> <p>电脑软件卸载,可以直接打开控制面板找到程序 在弹出界面里可以直接卸载注册表注册的软件,如果里孩虎粉臼莠铰疯歇弗忙面没有的软件,在电脑盘中有的话,那么说明这个软件不需要写入注册表,那么可以直接选择该软件文件夹直接shift+del删除。</p><p>联想集团</p><p>是1984年中国科学院计算技术研究所投资20万元人民币,由11名科技人员创办,是中国的一家在信息产业内多元化发展的大型企业集团,和富有创新性的国际化的科技公司。</p><p>从1996年开始,联想电脑销量一直位居中国国内市场首位;2005年,联想集团收购IBM PC(Personal computer,个人电脑)事业部;2013年,联想电脑销售量升居世界第一,成为全球最大的PC生产厂商。2014年10月,联想集团宣布了该公司已经完成对摩托罗拉移动的收购。</p><p>作为全球电脑市场的领导企业,联想从事开发、制造并销售可靠的、安全易用的技术产品及优质专业的服务,帮助全球客户和合作伙伴取得成功。联想公司主要生产台式电脑、服务器、笔记本电脑、智能电视、打印机、掌上电脑、主板、手机、一体机电脑等商品。</p><p>自2014年4月1日起, 联想集团成立了四个新的、相对独立的业务集团,分别是PC业务集团、移动业务集团、企业级业务集团、云服务业务集团。2016年8月,全国工商联发布“2016中国民营企业500强”榜单,联想名列第四。</p> </div>
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