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怎么删除linux里的conda linux安装conda

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conda是生物信息分析必备的环境,集成了很多优秀的软件,关键是解决了依赖包的问题,很好用。记录一下我安装conda的心得。

conda有miniconda和anaconda,我推荐还是使用miniconda吧,自己去安装一些东西,可能好使用一些。

conda的下载

下载对应版本即可,我下载的是linux的64位版本。

进入/root目录

cd /root

下载conda:

wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

conda的安装

安装命令:

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

一路安装下来,最后一步,一般选择no,不把conda加入环境,避免启动系统的时候就加载conda,后面我们想办法,让他在需要的时候再启动。

如果没有选择no取消自动启动,那么登录shell的时候自动进去base环境,我们可以运行命令conda config --set auto_acti【【微信】】来取消,如果反悔了,可以使用命令conda config --set auto_acti【【微信】】来重新自动进入base环境。

个人习惯,我喜欢把我的东西放到一个比较大的挂载分区,一般不和系统放在一起。

我把conda安装到/www/soft/miniconda3。

安装完成之后,输入命令:cd? /www/soft/miniconda3/bin

chmod 777 activate

然后把conda启动:

. http://www.taodudu.cc/news/activate

然后建立单独的自用环境

conda create -n pepper python=2

聪明人一眼就可以看出来,建立环境的作用就是可以区分python,分别建立python2和python3的环境,那么在不同的环境就可以使用不同版本python的软件。

然后把这个环境的启动加入bashrc。

输入命令:

vim ~/.bashrc

insert以下命令:

alias condapepper='. /www/soft/miniconda3/bin/acti【【微信】】'

也可以把这条命令单独放一行,重新加载一次系统配置使得alias命令生效,并且自动进去pepper环境

source ~/.bashrc

重启一样的效果。

然后输入命令

condapepper

成功启动conda的pepper环境。

加入频道conda config --add channels bioconda

conda config --add channels conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

conda的卸载

如果你是想卸载conda然后重装,那么最好先关闭相关目录进程

运行命令

fuser -km /www/soft/miniconda3/

然后

rm -rf? /www/soft/miniconda3/

conda的环境的退出

conda deactivate

特别提示:

如果在.bashrc文件中设置了登陆系统时自动进入canda的自定义环境,那么在本地登录系统想使用桌面的时候,一定要先退出环境,不然运行“startx”将出现错误,无法登录。

常用命令

查看condaconda info

查看包conda list

查看环境清单conda env list

安装包,比如snpeff【【微信】】

安装指定版本包,比如snpeff v4.3【【微信】】=4.3

删除包【【微信】】

从当前环境中移除包conda remo【【微信】】

更新某个包,比如snpeffconda update snpeff

更新所有包conda update --all

更新condaconda update conda

出了各种各样不知名的错误之后可以尝试这个命令

取消自动base环境命令conda config --set auto_acti【【微信】】

使用自动base环境命令就是设置为true了

取消SSL命令conda config --set ssl_【【微信】】

删除虚拟环境conda remove -n pepper --all

pepper为虚拟环境名称

删除虚拟环境中的某个包conda remo【【微信】】

pepper为虚拟环境名称,snpeff为包名

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电脑软件卸载,可以直接打开控制面板找到程序 在弹出界面里可以直接卸载注册表注册的软件,如果里孩虎粉臼莠铰疯歇弗忙面没有的软件,在电脑盘中有的话,那么说明这个软件不需要写入注册表,那么可以直接选择该软件文件夹直接shift+del删除。

联想集团

是1984年中国科学院计算技术研究所投资20万元人民币,由11名科技人员创办,是中国的一家在信息产业内多元化发展的大型企业集团,和富有创新性的国际化的科技公司。

从1996年开始,联想电脑销量一直位居中国国内市场首位;2005年,联想集团收购IBM PC(Personal computer,个人电脑)事业部;2013年,联想电脑销售量升居世界第一,成为全球最大的PC生产厂商。2014年10月,联想集团宣布了该公司已经完成对摩托罗拉移动的收购。

作为全球电脑市场的领导企业,联想从事开发、制造并销售可靠的、安全易用的技术产品及优质专业的服务,帮助全球客户和合作伙伴取得成功。联想公司主要生产台式电脑、服务器、笔记本电脑、智能电视、打印机、掌上电脑、主板、手机、一体机电脑等商品。

自2014年4月1日起, 联想集团成立了四个新的、相对独立的业务集团,分别是PC业务集团、移动业务集团、企业级业务集团、云服务业务集团。2016年8月,全国工商联发布“2016中国民营企业500强”榜单,联想名列第四。